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生物医学工程分属于工学和医学，是典型的交叉学科。事实上，一个专业名称对应两个专业代码的情况，通常发生在交叉学科。
交叉学科一览表(部分)
|
专业名称 |
可授学位类别 |
|
运动人体科学 |
教育学（０４）、理学（０７）、医学（１０） |
|
科学技术史 |
理学（０７）、工学（０８）、农学（０９）、医学（１０） |
|
统计学 |
理学（０７）、经济学（０２） |
|
电子科学与技术类（包括物理电子学、电路与系统、微电子与固体物理学、电磁场与微波技术） |
工学（０８）、理学（０７） |
|
风景园林学 |
工学（０８）、农学（０９） |
|
医学技术 |
医学（１０）、理学（０７） |
|
管理科学与工程 |
管理学（１２）、工学工学（０８） |
|
社会医学与卫生事业管理 |
管理学（１２）、医学（１０） |
|
教育经济与管理 |
教育学（０４）、管理学（１２） |
|
基础医学 |
医学（１０）、理学（０７） |
|
生物医学工程 |
医学（１０）、工学（０８）、理学（07） |
|
心理学（包括基础心理学、应用心理学、发展与教育心理学） |
教育学（０４）、理学（０７） |
|
药学 |
理学（０７）、医学（１０） |
|
力学 |
理学（０７）、工学（０８） |
|
食品科学与工程 |
工学（０８）、农学（０９） |
|
计算机科学与技术 |
理学（０７）、工学（０８） |
|
材料科学与工程 |
理学（０７）、工学（０８） |
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环境科学与工程 |
工学（０８）、理学（07）、农学（09） |
|
公共卫生与预防医学 |
理学（０７）、医学（１０） |
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中药学 |
理学（０７）、医学（１０） |
|
护理学 |
理学（０７）、医学（１０） |
|
设计学 |
艺术学（１３）、工学（０８） |
专业代码除了纯数字，偶尔还会“混”一些洋文，如吉林大学2013年的招生专业目录中法经济学的代码是0201J1。
代码中含字母的专业均为高校的自设专业。所谓自设专业，并不是高校想设置就可以设的，只有高校在某个一级学科上拿到博士点授权，才有资格申请自设特色专业，经过国家的严格审查批准后，才能招生。自设专业往往是该高校的传统特色专业或强势专业，只是在国家的学科专业目录中没有设置，才由高校自设。
如下表中吉林大学2013年硕士招生专业中学校自设专业都是吉大的优势专业;再如杭州师范大学的整体实力在全国虽不是很强，但是由于在中国法学界知名的法学家范忠信教授(享受国务院特殊津贴的学者，中国法律史协会执行会长)加盟该校，推动了其在法学领域的实力，该校也自设了法律文化专业(0301Z1)。
表2：吉林大学2013年硕士招生专业中学校自设专业目录
|
代码 |
专业 |
代码 |
专业 |
|
0501Z2 |
对外汉语教学 |
1203Z1 |
物流管理 |
|
1303L2 |
戏剧与影视学 |
0906Z1 |
兽医公共卫生 |
|
0201Z1 |
制度经济学 |
1007J1 |
再生医学 |
|
0201J1 |
法经济学 |
1007Z2 |
临床药学 |
|
1204Z1 |
公共治理与公共政策 |
0802Z2 |
工业工程 |
|
1204Z2 |
电子政务 |
0802Z1 |
车身工程 |
|
1201Z1 |
工程项目管理 |
0823Z1 |
物流工程 |
|
0702Z1 |
应用物理学 |
0828Z1 |
仿生科学与工程 |
|
0709Z1 |
数字地质科学 |
0818Z4 |
地下水科学与工程 |
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